Vào giai đoạn Triết học của “Chương trình Cử Nhân Thần Học”
1) Chủng sinh, tu sĩ, và giáo dân đáp ứng đủ các điều kiện đòi buộc theo từng cấp độ học thuật, đều có quyền đăng ký thi tuyển để theo học tại Học viện.
2) Để đăng ký thi tuyển vào chương trình S.T.B., thí sinh cần phải có:
a) Văn bằng Tốt nghiệp Phổ thông Trung học hoặc tương đương;
b) Văn bằng Cử nhân Đại học, hoặc một văn bằng hay trình độ tương đương;
3) Được xem là có văn bằng hay trình độ tương đương khi:
a) Có thời lượng và các môn học tương ứng tối thiểu 2/3 với chương trình đào tạo của trình độ đó.
b) Có văn bằng hay chứng chỉ, kèm theo bảng điểm các môn đã học, được vị Bề trên bản quyền chứng thực;
c) Được vị đặc trách của Chu kỳ đào tạo S.T.B, do Hội đồng khoa ủy quyền, xem xét và chấp thuận.
 Vào giai đoạn Thần học của “Chương trình Cử Nhân Thần Học”
1) Đối với sinh viên đã hoàn thành Hai năm Triết học tại Khoa Thần Học của HVCG:
a) Để được nhận vào học Giai đoạn Thần học, sinh viên phải hoàn tất các môn học và thi đậu các kỳ thi thuộc Giai đoạn hai năm Triết học trước đó.
b) Sinh viên có điểm trung bình toàn Giai đoạn Triết học từ 75/100 sẽ được tuyển thẳng lên Giai đoạn Thần học.
c) Sinh viên có điểm trung bình Giai đoạn Triết học từ 60 – 74/100, phải trải qua kỳ thi chuyển giai đoạn về Triết học Tổng quát và về Anh ngữ do HVCGVN tổ chức.
2) Đối với sinh viên chuyển từ trường khác sang HVCGVN:
a) Cần có Văn bằng Cử nhân Triết hoặc Chứng chỉ xác nhận đã hoàn tất chương trình Triết học do một Phân khoa triết hoặc Đại học Công giáo cấp. Trong trường hợp này, sinh viên chỉ cần đậu kỳ thi Anh ngữ do HVCGVN tổ chức.
b) Hoặc có Chứng chỉ của Đại chủng viện hay Học viện (có dự thi và trúng tuyển đầu vào giai đoạn Triết), xác nhận đã hoàn tất chương trình Triết học (kéo dài 2 hay 3 năm) để vào học Thần học, với bảng điểm có điểm trung bình cộng các môn từ 75/100 trở lên. Trong trường hợp này, sinh viên phải dự kỳ thi đầu vào giai đoạn Thần học gồm bài thi về Triết học Tổng quát và về Anh ngữ do HVCGVN tổ chức.
c) Trong mọi trường hợp, sinh viên cần có giấy giới thiệu của Bề trên bản quyền, và nói rõ lý do chuyển trường.

Vào Năm Chuẩn bị của “Chương trình Cao Học Thần Học”
– Để được nhận vào chương trình Năm Chuẩn Bị Cao học Thần học, các sinh viên phải hoàn tất các môn học và thi đậu các kỳ thi thuộc Chương trình Cử nhân Thần học trước đó.
– Có bằng S.T.B với điểm trung bình từ 75/100 trở lên; Hoặc đã học xong chương trình Triết -Thần ở một Đại chủng viện hay một Học viện có chương trình đào tạo tương đương, với bảng điểm có điểm trung bình cộng các môn từ 75/100 trở lên.

Vào “Năm Đào Tạo Mục Vụ cho các Ứng Viên Giáo Sĩ”
Để được nhận vào chương trình “Năm Đào Tạo Mục Vụ cho các Ứng Viên Giáo Sĩ”, các sinh viên hoàn thành chương trình triết học và thần học dành cho các ứng viên giáo sĩ. Các sinh viên HVCGVN hoàn thành năm III thần học.
Vì các đề tài hữu ích cho mục vụ, các tu sĩ và giáo dân cũng có thể đăng ký tham dự.